学校现有8个一级学科硕士学位授权点，5个专业学位类别硕士学位授权点；有4个省级一级重点学科，13个校级重点建设学科；1个省部共建国家级重点实验室培育基地，1个国家级实验教学示范中心，5个自治区产学研研究生联合培养基地，2个省级实验教学示范中心，4个省级重点实验室，校级科研平台18个。近三年获得5篇自治区级优秀硕士论文。在籍研究生532人，硕士研究生导师357名。近年来，学校结合自身实际和区域特点，努力探索适合于地处新疆南疆，农业人口比重大等区情的招生、培养、学位授予等教育规律，在高层次硕士研究生培养方面开展了积极的工作，培养了一批“下得去、留得住、用得着、干得好”的高层次应用型人才，对促进区域经济社会发展和实现新疆“长治久安”发挥着不可替代的作用。
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